在保健食品经营企业卫生许可证的办理过程中，是需要准备以下办理材料的，包括了：

1、《市保健食品（经营）卫生许可证申请书》；

2、营业执照复印件1份；新开办企业提供（法定代表人或者负责人资格证明复印件（董事会决议或任命文件）、身份证复印件以及工商行政部门出具的预先核准证明复印件）；

3、经营场所的使用证明（房屋/土地产权证明或者租赁协议复印件）；

4、经营场所场地平面布局图；

5、企业卫生管理组织和制度的材料、质量保证体系及质量控制的相关文件；（产品索证制度或首营制度，以及人员、场地的卫生管理制度）；

6、从业人员健康检查证明复印件1份；

7、从业人员保健食品卫生知识培训材料1份；

8、食品药品监督管理部门认为有必要提供的其他材料；

9、申报材料真实性的自我保证声明，包括企业对材料作出如有虚假承担法律责任的承诺；

10、凡申请企业申报材料时，申请人不是法定代表人或负责人本人，企业应当提交《授权委托书》。